Tiếp theo bộ phim Beverly Hills Chihuahua, ở phần 2 này Chloe và Papi trở về Beverly Hills, nơi chúng đã kết hôn với nhau và trở thành bậc cha mẹ đáng tự hào của 5 chú cún nghịch ngợm và quái chiêu là Aly, Lala, Pep, Rosa và Jr.
Một chú gấu koala nhỏ dấn thân vào cuộc hành trình đầy nguy hiểm ở Úc với hy vọng tìm lại được người cha mất tích của mình.
Mặc dù mới đến ở trên thiên đàng, nhưng cậu bé thiên thần 5 tuổi với tên gọi “Littlest Angel” muốn trở về Trái đất với người bạn Halo của mình, một con chó nhỏ dễ thương biết nói chuyện và có một đôi cánh, để lấy lại hộp kho báu của mình bị bỏ quên. Trong khi ở trên trái đất, cậu bé bị bắt cóc bởi những người chủ đáng sợ của công ty Traveling Freak Show.
Tia sét đã tách Chuyến xe khoa học kỳ thú thành ba phần, khiến lớp học phân tán khắp thế giới cùng các phiên bản khác nhau của cô Frizzle trên mỗi chiếc xe!
Câu chuyện này diễn ra vào khoảng thời gian giữa 2 phần Madagascar và Madagascar 2, bao gồm các nhân vật đã quen thuộc với khán giả. Phim bắt đầu khi Ông già Noel và các con tuần lộc gặp sự cố trong lúc hạ cánh xuống một hòn đảo. Sau cú va đập đó, ông đã mất trí nhớ nên không thể tiếp tục công việc phân phát quà của mình. Vì vậy, Alex, Marty, Melman, Gloria và nhóm chim cánh cụt đã thay ông đảm nhận trách nhiệm này. Thế rồi bao nhiêu tình huống dở khóc dở cười đã xảy ra trong suốt quá trình làm