Sau tất cả những gì diễn ra ở phần phim trước, mọi thứ lúc này đây vẫn chìm ngập trong lo âu. Liên Minh Sannou tuyên bố giải thể!? Noboru bị tai nạn bất ngờ, tính mạng không rõ ra sao!? Tập đoàn Iemura / Cửu Long Hội vẫn đang ngày đêm âm mưu thôn tính khu vực S.W.O.R.D.
Dan (Shori Sato) là học sinh trung học năm thứ nhất. Cậu không giỏi trong học tập và các môn thể thao. Cậu thường dành hầu hết thời gian rảnh rỗi ở nhà. Một ngày nọ, linh hồn của bố cậu nhập vào thân xác của Dan. Bố cậu đã chết sau một vụ tai nạn. Vấn đề duy nhất là ông ấy có tài năng vượt trội về mọi thứ và bây giờ, Dan nhận được món quà tương tự. Cậu bắt đầu chơi giỏi bóng rổ và hẹn hò cùng cô gái nổi tiếng ở trường. Dan cũng từ đó trở nên nổi tiếng. Cuộc sống trong trường của cậu diễn ra một
ở phần này đội Kintori tiếp tục tham gia vào những cuộc phỏng vấn tội phạm gay cấn mà vẫn phải dưới sự giám sát của camera. Cùng với đó là cuộc điều tra sâu hơn của Yukiko về cái chết của chồng.
Rainbow Line là mạng lưới xe lửa phép thuật mang sức mạnh của Imagination tồn tại trong thế giới con người. Đối nghịch với Rainbow Line là Shadow Line – một thế lực muốn thu thập nỗi buồn khổ của trẻ em để mở rộng tuyến đường sắt của chúng nhằm thống trị thế giới. Chiến đấu chống lại Shadow Line là 5 người bạn được chọn trở thành ToQGer – nhóm chiến binh có năng lực sử dụng Imagination bảo vệ thế giới khỏi bóng tối
Homonji Sharaku (Yuji Oda) là con trai trưởng của một gia đình thiên tài nghiên cứu về tội phạm hàng thế hệ. Con trai trưởng của gia đình Homonji là Homonji Sharaku, anh có chỉ số IQ là 246.