Nobita muốn được đến thiên đường trên chín tầng mây, nơi mà cậu thường nghe nói đến trong truyện cổ tích. Không cần tìm kiếm đâu xa, bằng những bảo bối của mình, cả nhóm Doraemon đã tạo ra một thiên đường riêng và vô hình đối với người bên ngoài. Họ gặp một cậu bé nhưng hôm sau câu ta đã biến mất.
Sau khi ngăn chặn một nhóm buôn lậu Vizorium, Kei và Yuri, các Thiên thần đáng yêu (thường được gọi là Cặp đôi bẩn thỉu), được gửi đến Agerna, một hành tinh giàu Vizorium, một khoáng chất cần thiết cho du hành vũ trụ
Asuna là một học sinh trung học, bố mất sớm, cô bé sống với người mẹ làm y tá luôn bận rộn không ở nhà. Là một cô bé ngoan, nhưng luôn cô độc, thú vui duy nhất là lắng nghe những âm thanh bí ẩn từ chiếc radio làm từ viên đá của cha để lại tại ngọn đồi sau nhà. Vô tình một ngày cô bé tìm được một người bạn, nhưng người bạn ấy đột nhiên biến mất
Một kẻ tự xưng là siêu trộm Kaito Deluxe (DX) đã đột nhập vào nhà Nobita lúc nửa đêm và lấy đi quả chuông của Doraemon. Điều này đưa Nobita và nhóm bạn vào cuộc phưu lưu truy tìm tung tích của quả chuông tại 1 nơi mang tên "Viện Bảo Tàng Bảo Bối Tương Lai", đây là nơi lưu giữ tất cả các bảo bối tại thế kỷ 22. Cuộc điều tra trở nên phức tạp và kỳ lạ hơn khi có sự xuất hiện của những nhân vật mới.
Cậu học sinh trung học Yuu và người bạn Haru vướng vào một vụ án liên quan đến người bạn thời thơ ấu Kotona, buộc họ phải qua lại giữa một thế giới khác nhưng có phần giống với thế giới của họ, Ni no Kuni. Thế giới thực và Ni no Kuni, khi tính mạng của Kotona gặp nguy hiểm, lựa chọn cuối cùng mà ba người họ phải thực hiện trong Ni no Kuni là gì?